由于我國證據(jù)立法滯后，與之相配套的證據(jù)制度仍不完善，加上因歷史和現(xiàn)實的諸多原因，農業(yè)技術司法鑒定的現(xiàn)狀不能滿足社會需要，也不適應深化司法改革的要求，在實踐中暴露出諸多問題。 (一)、農業(yè)技術司法鑒定的體系尚未形成 我國的司法鑒定體制是脫胎于計劃經(jīng)濟，現(xiàn)行的司法鑒定體制還帶有計劃經(jīng)濟的痕跡。由于農業(yè)技術司法鑒定是司法鑒定新的類型，過去無論是司法行政機關還是法院都沒有直接涉及農業(yè)技術司法鑒定。2005年2月以前，人民法院組織入冊社會鑒定機構時才有所涉及，司法行政機關搞面向社會的司法鑒定機構時才剛剛起步。據(jù)文獻記載(五)農業(yè)技術司法鑒定人員的素質有待于進一步提高。目前我國農業(yè)技術司法鑒定的從業(yè)人員不但數(shù)量少，而且知識結構極不合理，特別是法律知尤為缺乏。按照《全國人大常委會關于司法鑒定管理問題的決定》中明確提出司法鑒定人必須具備承擔本專業(yè)司法鑒定的能力和水平，止2002年底，我國在司法行政機關登記的司法鑒定機構中有司法會計鑒定683家、建筑工程司法鑒定機構354家、法醫(yī)類司法鑒定393家、文書司法鑒定106家，精神疾病司法鑒定106家。而農業(yè)司法鑒定的機構屈指可數(shù)，江蘇省2003年才批準設立具有司法鑒定資質的農業(yè)技術司法鑒定機構1家，有司法鑒定資質的司法鑒定人僅10人，遠不能滿足社會的需要。這些數(shù)據(jù)表明從全國范圍來看，農業(yè)技術司法鑒定還處于起步階段，農業(yè)技術司法鑒定的體系尚未形成。 (二)農業(yè)技術司法鑒定機構的管理尚不到位。按照的有關規(guī)定，面向社會的司法鑒定機構由司法行政機關管理和監(jiān)督，司法鑒定機構必須獲準登記并依法領取司法鑒定行政許可證后才能開展司法鑒定業(yè)務，司法鑒定人必須取得執(zhí)業(yè)證書和入冊才能從事司法鑒定工作。現(xiàn)代農業(yè)是復雜的系統(tǒng)工程，涉及到農業(yè)自然環(huán)境(天氣、土地等)、農業(yè)生物(動植物)、人為技術、農業(yè)生產資料、農業(yè)經(jīng)濟與市場、勞動者素質等多種因素，農業(yè)技術司法鑒定涉及面廣、影響因素多，專業(yè)性強，技術難度大，這就對農業(yè)技術司法鑒定機構和鑒定人提出了更高的要求，目前我國農業(yè)司法鑒定機構一般都依托農業(yè)科研院所和高等院校的人才優(yōu)勢和技術優(yōu)勢開展工作，而且定位于非盈利機構。從管理的現(xiàn)狀來看，無論是對鑒定機構的管理還是對司法鑒定人的管理以及對司法鑒定的監(jiān)督管理都遠未到位。法律法規(guī)規(guī)定，不具有鑒定資質的科技人員不得從事司法鑒定工作，出具的“鑒定結論”不能作為司法機關偵查、檢察、審判的法定依據(jù)，司法機關需要司法鑒定的案件必須委托有鑒定資質的鑒定機構進行。目前農業(yè)技術司法鑒定機構偏少與農村對農業(yè)技術司法鑒定需求量的日益增加的矛盾較為突出，致使一些基層法院沒有嚴格按規(guī)定將需要鑒定的案件委托給有資質的農業(yè)技術司法鑒定機構進行鑒定，造成了有限的農業(yè)技術司法鑒定資源利用不充分或浪費。 (三)農業(yè)技術鑒定的法律法規(guī)建設落后于社會需要。我國《證據(jù)法》沒有出臺，也沒有《司法鑒定條例》，更也沒有農業(yè)技術司法鑒定的專門法規(guī)。關于司法鑒定的法律雖然在三大訴訟法中均有涉及(總共7條)，但過于原則，操作性差，不能適應法治需要，后來各部門有一些司法解釋性質的規(guī)定出臺，但權威性不高、適用范圍受局限，甚至各行其是、互相矛盾，在一定意義上講，相關法律規(guī)定的欠缺是司法鑒定現(xiàn)存諸多問題的根源。以至于在司法實踐中，出現(xiàn)了多次鑒定和重復鑒定的情況，且鑒定結論差異較大，甚至出現(xiàn)截然相反的結論，這不僅使人們對司法鑒定的權威性產生懷疑，而且給法院審理案件增加了難度。更為嚴重的是鑒定機關因為種種利害和利益關系，各自為鑒，互不信任的情況也有可能發(fā)生，而這些情況又缺乏追究其法律責任的依據(jù)。 (四)司法鑒定的判別依據(jù)不明確，農業(yè)技術司法鑒定的標準、規(guī)范尚不完備。在農業(yè)技術司法鑒定中，技術標準、技術規(guī)范是辯明技術是非曲折的重要依據(jù)。農業(yè)技術的內容十分廣泛，且受環(huán)境的影響較大，技術標準、操作規(guī)范的不健全、不完善已成為我國開展農業(yè)技術司法鑒定的重大障礙。隨著市場經(jīng)濟的發(fā)展，我國與國際經(jīng)濟接軌，農產品標準化、生產技術的規(guī)范化越來越受到生產者、經(jīng)營者和消費者的重視。我國雖已制定了一大批農業(yè)技術方面的標準、行業(yè)標準和企業(yè)標準，但遠不能適應需要，特別是作為衡量鑒定結論的農業(yè)技術司法鑒定的技術標準和規(guī)范很少，但如果缺乏必要的技術標準，農業(yè)技術鑒定專家的工作難度是可想而知的，因此，加強農業(yè)技術司法鑒定的標準、規(guī)范的制定和完善將是相當長的時間內的重要工作。[7]
